「FAAC」と呼ばれるもので「neroAAC Encoder」ではありません。
この「FAAC」はneroAAC Encoderとは性能や使い方が異なり、
使用可能なコマンドや規格のオプションに違いがあります。
ここの情報によるとneroAAC Encoderにある
＿・ 2passエンコード
＿・ HE-AAC/HE-AACv2
＿・ CBR（固定ビットレート）
この3つに相当するものがないようです。
逆にneroAAC Encoderにはないものとして
＿・ Main/SSR/LTP Profile （特性が異なり対応機器がちょっと少ない）
＿・ MPEG-2AAC （MPEG-4AACとのバージョン違い）
＿・ TNS （AACの規格オプション）
＿・ サンプリングレート変更
＿・ Rawペイロード
この5つがあるようです。
また品質設定の変域が0.00～1.00のneroAAC Encoderに対して
FAACは変域が1～1000らしいです。
ということはコマンド的にはABRもVBRも対応のはずなのですが・・・
なぜかXMediaRecode（3.1.7.8）では上手く設定できない場合があるようです。
書式のミスか、プログラムのミスか・・・
ちなみに音質ではneroAAC Encoderの方が好評かもしれません。お試しあれ。
